(1)物流费用之全貌难以闪现
由于物流本钱大多数混入其他费用之中，很难看出其全貌。
(2)物流本钱之间存在效益背反现象
在物流功用之间，一种功用本钱的减少会使另一种功用本钱添加，由于各种费用的相相关性，有必要考虑全体最佳本钱。也就是说，物流办理的方针是寻求物流总本钱的最小化。所谓效益背反，是指改动体系中任何一个要素，都会影响到其他要素的改动。具体来说，要使体系中任何一个要素增益，必将对体系中其他要素发生减损的效果。
(3)物流部分难以操控悉数物流本钱
在物流本钱中，有不少是物流部分不能操控的。从出售方面来看，物流本钱并没有区别剩余的服务和规范服务的不同。在物流功用之间，一种功用本钱的减少会使另一种功能的本钱增多。由于各种费用相互相关，所以有必要考虑全体的最佳本钱。
