在信息系统建设中,由于缺乏科学、有效地系统规划,不少已经建成或正在建设的系统仍然面临一系列问题，主要包括：系统建设与组织发展的目标和战略不匹配；系统建设后对管理并无显著改善；系统不能适应环境变化和组织改革的需求；系统使用人员的素质较低；系统开发环境落后，技术方案不合理；系统开发以及运行维护的标准、规范混乱；系统开发资源短缺，投入少，面对系统的期望过高等。
为了克服物流信息系统建设过程中出现上述问题，制定管理信息系统战略规划就显得十分重要。通过制定规划，可合理分配和利用信息资源（信息、信息技术和信息生产者），节省信息系统的投资；找出存在的问题，正确地识别出管理信息系统为达成公司目标而必须完成的任务，促进信息系统应用，从而带来更多的经济效益。
系统规划中，首先要确定管理信息系统的目标，因为对于各种系统规划方法，都是围绕管理信息系统的目标进行的。系统规划的目标是制定管理信息系统的长期发展方案，决定管理信息系统在整个生命周期内的发展方向、发展规模和发展过程。