近年来，通过远洋船舶进行潜船偷渡活动日渐猖獗，特别是非洲和南美洲等贫穷落后地区尤为突出，船舶稍有疏漏，就很有可能发生偷渡事件，不仅给船舶正常的安全生产和生活秩序带来较大的影响，而且遣返偷渡人员的工作更是困难重重，如果处理不当，将会严重影响到中远的声誉乃至国家的形象。中远航运所属船舶60％以上经常靠泊非洲和南美洲港口，且船舶多为特种杂货船，这种船型对偷渡人员来说更容易藏匿，船舶防偷渡工作的任务更加艰巨。面对这种情况，中远航运各船舶结合ISPS的实施，采取了一系列防偷渡措施。
首先采取了只留一个通道的办法。中远航运的滚装船、半潜船等船型由于多个通道或整个甲板都敞开，人员可以随意上下，给船舶值班人员登记和核查人数增加了困难。为了准确掌握上下船人员的数量，随着ISPS规则的有效实施，船舶通过与港方沟通协商，对船舶停靠码头期间只留一个通道达成了共识，并与港口当局签订了《保安协议》，明确各自的保安责任。如负责执行欧洲至西非班轮任务的赤峰口轮，每次在放下艉跳（装货出入口）的同时，将舷梯收起来，只留下一个通道，规定只有联检官员、代理、理货人才能通过艉跳侧门进入生活区，工人、工头只能通过克令桅房上甲板下大舱。船舶实行通道限制后，对外来登轮人员的控制和统计更加方便，有效地将无关人员拒绝在船舷之外，达到了防线前移的目的。
其次是变被动登记为主动查询。根据历年来船舶在非洲查获的偷渡人员的情况来看，偷渡者多为25岁以下的男性，多数是混在上下船的工人中上船，少部分则是由工人或看船人引领上船。根据这些特点，中远航运的船舶在防偷渡工作中，不断改变原有的做法，把以往靠搞人海战术找偷渡分子变为使企图潜船偷渡人员根本没有机会登船，变被动防守为主动进攻。船员在对登船人员进行登记时，改以往不询不问的被动登记为主动查询人员证件，要求登船人员的证件以码头签发的为主，身份证不能作为登船的有效证件，特别注意对30岁以下男性人员的身份进行判断，认真把好登船关口。
为了防止值班人员语言不过关，船上将检查用的常用英文单词打印在防偷渡值班表背面备用。
为了使登船人员能配合检查，船员坚持做到表情和蔼，态度坚决，即使对穿制服的官员也不例外，检查完一个，登记和放行一个。此外，每隔两小时，船上组织值班驾驶员和防偷渡加强班人员对外来登船人数进行审核，询问可疑人员，让偷渡者无处藏身。
再次，做到值班岗位不空档。船舶停靠在码头上，码头边人来人往，企图潜船偷渡分子经常在码头上有意地观察船员的值班情况，寻找船员不经意离开的机会迅速混上船。中远航运船舶为了不留任何漏洞，要求值班岗位不能有任何的空档，即使是喝水吃饭上厕所也必须找人代岗后才能离开，还要求值班人员上班前准备好雨衣，刮风下雨也不能离开岗位，这样就不给偷渡分子任何可乘之机。此外，梯口值班员还要监视码头人员的行踪，防止有人靠近缆桩，通过爬大缆上船。
同时，船舶还要做好提前预检工作。
离港前进行"地毯式"大检查是船舶防止发生潜船偷渡事件的最后防线之一。但是，为了节约船期和港口使费以及受港口泊位等因素的影响，往往在完货后代理马上就要安排船舶离港开航，而此时船舶既要开展离港前防偷渡大搜查，又要进行开航前的各项准备工作，因此防偷渡检查在时间和人员上得不到落实，防偷渡工作容易走过场。为此，为了保证船舶安全经营和船舶保安两不误，中远航运要求船舶必须不定期进行防偷渡预检，将防偷渡关口前移，完货一个舱检查一个舱，预检后对不开启的大舱、库房等采取封闭措施并做上标识和暗记，平时保安加强班人员可对其进行检查，如果原标志和暗记没有发现异常，在离港检查时可不打开，这样就可以节省开航前检查的时间，达到应有的效果。
全员参与是做好防偷渡工作的关键。中远航运要求进入偷渡猖獗港口的船舶，船员要提前行动起来，人人参与，严防偷渡。进港前将所有能上锁的仓库锁起来，能关的门窗关起来，能封的道门封起来，并且作上记号，防止有人伪装。到港后，船长要求代理和港口保安配合船舶做好保安工作，签署《保安协议》，所有登轮人员要接受证件检查和行李检查。
大副要求工头提供上班人数和上下班时间表，工人上船必须出示工作证件，并划定活动范围。对出现在工作场所以外的人，特别是年轻人，所有船员都有责任主动询问，及时报告，妥善处理。全体船员在船舶停留港口期间，都时刻绷紧防偷渡这根弦，形成领导勤查、当班船员认真负责、其他船员多观察的"全员皆兵"局面。